Basis data sekuens GenBank merupakan akses terbuka, koleksi beranotasi dari semua sekuens nukleotida yang tersedia untuk umum dan terjemahan protein mereka. Basis data ini diproduksi dan dikelola oleh National Center for Biotechnology Information (NCBI) bagian dari Institut Kesehatan Nasional di Amerika Serikat, yang juga menjadi bagian dari International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).

GenBank
Konten
DeskripsiPengurutan nukleotida untuk lebih dari 300.000 organisme dengan anotasi bibliografi dan biologis yang mendukung.
Jenis data
  • Pengurutan nukleotida
  • Pengurutan protein
OrganismeSemua
Kontak
Pusat penelitianNCBI
Kutipan utama21071399
Tanggal rilis1982; 38 tahun lalu (1982)
Akses
Format data
Situs webNCBI
URL pengunduhanncbi ftp
URL layanan web
Perangkat
WebBLAST
Perangkat lunakBLAST
Lain-lain
LisensiTidak jelas[1]

GenBank dan kolaboratornya menerima sekuens urutan lebih dari 100.000 organisme berbeda yang diproduksi di laboratorium di seluruh penjuru dunia. Basis data dimulai pada tahun 1982 oleh Walter Goad dan Laboratorium Nasional Los Alamos. GenBank telah menjadi basis data penting untuk penelitian di bidang biologi dan telah tumbuh pesat dalam beberapa tahun terakhir, mencapai tingkat pertumbuhan eksponensial dengan berhasil menggandakan jumlah data dalam waktu 18 bulan.[2][3]

Rilis 194, diproduksi pada Februari 2013, berisi lebih dari 150 miliar data nukleotida di lebih dari 162 juta sekuens.[4] GenBank dibangun dengan pengiriman data langsung dari laboratorium individu, dan juga pengiriman data massal dari pusat sekuensing skala besar.

ReferensiSunting

  1. ^ The download page at UCSC says "NCBI places no restrictions on the use or distribution of the GenBank data. However, some submitters may claim patent, copyright, or other intellectual property rights in all or a portion of the data they have submitted. NCBI is not in a position to assess the validity of such claims, and therefore cannot provide comment or unrestricted permission concerning the use, copying, or distribution of the information contained in GenBank."
  2. ^ Benson D; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Wheeler, D. L.; et al. (2008). "GenBank". Nucleic Acids Research. 36 (Database): D25–D30. doi:10.1093/nar/gkm929. PMC 2238942 . PMID 18073190. 
  3. ^ Benson D; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Sayers, E. W.; et al. (2009). "GenBank". Nucleic Acids Research. 37 (Database): D26–D31. doi:10.1093/nar/gkn723. PMC 2686462 . PMID 18940867. 
  4. ^ "GenBank release notes". NCBI.