Serin protease (atau serin endopeptidase) kelompok enzim-enzim yang membelah ikatan peptida pada protein. Serin berperan sebagai asam amino nukleofilik.[1] Serin protease ditemukan dalam jumlah yang cukup baik pada organisme eukariota maupun prokariota. Serin protease terdiri atas dua kategori besar berdasarkan strukturnya yaitu struktur seperti kimotripsin (seperti tripsin) atau seperti subtilisin[2]

Serine endopeptidase
Struktur kristal kimotripsin sapi. 1CBW.
Pengidentifikasi
Nomor EC3.4.21.-
Basis data
IntEnztinjauan IntEnz
BRENDAentri BRENDA
ExPASytinjauan NiceZyme
KEGGentri KEGG
MetaCycjalur metabolik
PRIAMprofil
Struktur PDBRCSB PDB PDBe PDBsum
Struktur kristal of tripsin, salah satu jenis serin protease.

Klasifikasi

sunting

Sistem klasifikasi protease MEROPS memiliki 16 superfamili (tahun 2013) yang tiap superfamili terdiri dari banyak famili. Setiap superfamili menggunakan dyad dalam ikatan protein yang berbeda sehingga menyebabkan evolusi konvergen mekanisme katalitik.

Untuk superfamili P terdiri dari gabungan kelas famili nukleofil campuran. Superfamili S adalah serin protease murni.

Famili serin protease
Protein superfamili Famili Contoh
SB S8, S53 Subtilisin (Bacillus licheniformis)
SC S9, S10, S15, S28, S33, S37 Prolil oligopeptidase (Sus scrofa)
SE S11, S12, S13 D-Ala-D-Ala peptidase C (Escherichia coli)
SF S24, S26 Signal peptidase I (Escherichia coli)
SH S21, S73, S77, S78, S80 Sitomegalovirus (herpesvirus 5)
SJ S16, S50, S69 Lon-A peptidase (Escherichia coli)
SK S14, S41, S49 Clp protease (Escherichia coli)
SO S74 K1F endosialidase CIMCD (Enterobacteria phage K1F)
SP S59 Nucleoporin 145 (Homo sapiens)
SR S60 Lactoferin (Homo sapiens)
SS S66 Murein tetrapeptidase LD-karboksipeptidase (Pseudomonas aeruginosa)
ST S54 Rhomboid-1 (Drosophila melanogaster)
PA S1, S3, S6, S7, S29, S30, S31, S32,
S39, S46, S55, S64, S65, S75
Kimotripsin A (Bos taurus)
PB S45, S63 Penicillin G asilase precursor (Escherichia coli)
PC S51 Dipeptidase E (Escherichia coli)
PE P1 DmpA aminopeptidase (Ochrobactrum anthropi)
None S48, S62, S68, S71, S72, S79, S81

Referensi

sunting
  1. ^ Hedstrom, L. (Dec 2002). "Serine protease mechanism and specificity". Chem Rev. 102 (12): 4501–24. doi:10.1021/cr000033x. PMID 12475199. 
  2. ^ Madala PK, Tyndall JD, Nall T, Fairlie DP (Jun 2010). "Update 1 of: Proteases universally recognize beta strands in their active sites". Chem Rev. 110 (6): PR1–31. doi:10.1021/cr900368a. PMID 20377171.