(*) Hanya untuk rute BD-SGU. 2 Kereta bagasi dilepas di Surabaya Gubeng untuk dilangsir menuju Surabaya Kota sedangkan KA Mutiara Selatan melanjutkan perjalanan menuju Malang. Dari Malang KA Mutiara Selatan tanpa membawa Gerbong bagasi. Sesampainya di SGU KA Mutiara Selatan akan disambungkan dengan 2 Gerbong barang
* Dari Malang KA Mutiara Selatan tanpa membawa Gerbong bagasi. Sesampainya di SGU KA Mutiara Selatan akan disambungkan dengan 2 Gerbong bagasi kembali dan akan melanjutkan lagi keberangkatan dari Surabaya menuju pulang ke bandung.
*
* Rangkaian kereta ini ini seringkali bertukar kereta dengan KA Malabar, Argo Parahyangan Tambahan, atau Lodaya Tambahan. Misalnya kereta eksekutif K1 untuk Argo Parahyangan, Malabar, dan Lodaya Tambahan selanjutnya kereta bisnis K2 untuk, Lodaya Tambahan dan Malabar, selanjutnya kereta makan maupun kereta makan pembangkit M1/KMP2/MP2/KMP3/MP3/KP3 untuk Argo Parahyangan Tambahan, Lodaya Tambahan.
