Menurut [[Kundalini yoga]], Ganesa menempati [[cakra]] pertama, yang disebut ''muladhara''. ''Mula'' berarti "asal, utama"; ''adhara'' berarti "dasar, pondasifondasi". Cakra muladhara adalah hal penting yang merupakan manifestasi atau pelebaran pokok-pokok kekuatan ilahi yang terpendam.<ref name="Cakra">Tantra Unveiled: Seducing the Forces of Matter & Spirit By Rajmani Tigunait; Contributor Deborah Willoughby ; Published 1999; Himalayan Institute Press; hal. 83; ISBN 0-89389-158-4.</ref> Hubungan Gansea dengan hal ini juga diterangkan dalam ''[[Ganapati Atharwashirsa]]''. Courtright menerjemahkan pernyataan sebagai berikut: "[O Ganesa,] Engkau senantiasa menempati urat sakral di pondasifondasi tulang punggung [mūlādhāra cakra]."<ref>Translation. Courtright, hal. 253.</ref> Maka dari itu, Ganesa memiliki kediaman tetap dalam setiap makhluk yang terletak pada Muladhara. Ganesa memegang, menopang dan memandu [[cakra|cakra-cakra]] lainnya, sehingga ia mengatur kekuatan yang mendorong cakra kehidupan.<ref name="Cakra"/>
