Rangka baca terbuka

Rangka baca terbuka atau open reading frame di dalam bahasa Inggris adalah bagian tanpa kodon stop dari rangka baca ADN. Di dalam proses translasi ADN, setiap tiga basa nukelotida (kodon) diterjemahkan menjadi satu asam amino. Menggunakan prinsip ini terdapat 6 rangka baca yang mungkin di dalam menerjemahkan kodon, yaitu +1, +2, +3, -1, -2, dan -3, di mana tanda + melambangkan utas sense, dan - melambangkan utas nonsense. Pada praktiknya, rangka baca terbuka cenderung merupakan rangka baca yang menghasilkan utas protein paling panjang.[1] Open Reading Frame (ORF) adalah urutan triplet nukleotida yang dibaca sebagai codon yang menentukan asam amino, satu untaian DNA memiliki tiga frame pembacaan yang memungkinkan. Panjang dari ORF dapat mengindikasikan daerah pengkodean protein kandidat dalam urutan DNA. Bentuk ORF dapat berupa DNA atau mRNA, hal ini bergantung pada kebutuhan peneliti. Suatu ORF dapat dikatakan ORF jika satu rangkaian dengan rangkaian lainnya tidak menggunakan startcodon yang sama.

ReferensiSunting

  1. ^ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gorf/ ORF Finder (Open Reading Frame Finder)