RNA panjang non-penyandi


RNA panjang non-penyandi (long non-coding RNA, long ncRNA, lncRNA) didefinisikan sebagai transkrip lebih panjang dari 200 nukleotida yang tidak diterjemahkan menjadi protein.[1] Batas yang agak acak ini membedakan ncRNA panjang dari RNA pendek non-penyandi seperti RNA-mikro (microRNA, miRNA), RNA pendek interferensi (siRNA), RNA yang berinteraksi dengan piwi (piRNA), RNA nukleolar pendek (snoRNA), dan RNA pendek lainnya.[2]

Sebagian besar genom mamalia tidak disandi menjadi protein yang fungsional. Namun, banyak dari DNA non-penyandi ini masih ditranskripsi, sering kali untuk menghasilkan produk RNA yang memiliki peran dalam perkembangan. Beberapa molekul ini disebut RNA non-coding panjang (lncRNA) karena mengandung lebih dari 200 pasangan basa: transkrip ini menyempurnakan ekspresi gen dengan berinteraksi dengan kromatin dan mesin transkripsi di dalam sel.[3]

Otak mengekspresikan lebih banyak lncRNA daripada bagian tubuh lainnya,[4] tetapi masih sedikit yang diketahui tentang peran molekul-molekul tersebut.[5][6]

Signifikansi klinis

sunting

RNA panjang non-penyandi yang disebut lnc-NR2F1 mengatur beberapa gen neuronal, termasuk beberapa yang terlibat dalam autisme dan cacat intelektual.[7]

Referensi

sunting
  1. ^ Perkel, Jeffrey M. (2013-6). "Visiting "noncodarnia"". BioTechniques. 54 (6): 301, 303–304. doi:10.2144/000114037. ISSN 1940-9818. PMID 23750541. 
  2. ^ Ma, Lina; Bajic, Vladimir B.; Zhang, Zhang (2013-6). "On the classification of long non-coding RNAs". RNA biology. 10 (6): 925–933. doi:10.4161/rna.24604. ISSN 1555-8584. PMC 4111732 . PMID 23696037. 
  3. ^ Ponting, Chris P.; Oliver, Peter L.; Reik, Wolf (2009-02-20). "Evolution and functions of long noncoding RNAs". Cell. 136 (4): 629–641. doi:10.1016/j.cell.2009.02.006. ISSN 1097-4172. PMID 19239885. 
  4. ^ Derrien, Thomas; Johnson, Rory; Bussotti, Giovanni; Tanzer, Andrea; Djebali, Sarah; Tilgner, Hagen; Guernec, Gregory; Martin, David; Merkel, Angelika (2012-9). "The GENCODE v7 catalog of human long noncoding RNAs: analysis of their gene structure, evolution, and expression". Genome Research. 22 (9): 1775–1789. doi:10.1101/gr.132159.111. ISSN 1549-5469. PMC 3431493 . PMID 22955988. 
  5. ^ D'haene, Eva; Jacobs, Eva Z.; Volders, Pieter-Jan; De Meyer, Tim; Menten, Björn; Vergult, Sarah (06 20, 2016). "Identification of long non-coding RNAs involved in neuronal development and intellectual disability". Scientific Reports. 6: 28396. doi:10.1038/srep28396. ISSN 2045-2322. PMC 4913242 . PMID 27319317. 
  6. ^ Aprea, Julieta; Prenninger, Silvia; Dori, Martina; Ghosh, Tanay; Monasor, Laura Sebastian; Wessendorf, Elke; Zocher, Sara; Massalini, Simone; Alexopoulou, Dimitra (2013-12-11). "Transcriptome sequencing during mouse brain development identifies long non-coding RNAs functionally involved in neurogenic commitment". The EMBO journal. 32 (24): 3145–3160. doi:10.1038/emboj.2013.245. ISSN 1460-2075. PMC 3981144 . PMID 24240175. 
  7. ^ Ang, Cheen Euong; Ma, Qing; Wapinski, Orly L.; Fan, ShengHua; Flynn, Ryan A.; Lee, Qian Yi; Coe, Bradley; Onoguchi, Masahiro; Olmos, Victor Hipolito (2019-01-10). "The novel lncRNA lnc-NR2F1 is pro-neurogenic and mutated in human neurodevelopmental disorders". eLife. 8. doi:10.7554/eLife.41770. ISSN 2050-084X. PMID 30628890.