Tumbuhan berbiji sendiri memiliki [[tumbuhan paku]] sejati (Pteridophyta) sebagai kerabat terdekat.
=== Gymnospermae (Tumbuhan berbiji terbuka) ===
[[Gymnospermae]] berasal dari bahasa Yunani yaitu, Gymno =terbuka atau telanjang dan sperma=biji. Anggota Gymnospermae memiliki ciri utama berupa bakal biji yang tumbuh pada permukaan megasporafil (daun buah). Tumbuhan ini memiliki habitus semak, perdu, atau pohon. Akarnya merupakan akar tunggang, batang tumbuhan tegak lurus dan bercabang-cabang.
:Gymnospermae tidak memiliki bunga yang sesungguhnya, sporofil terpisah-pisah atau membentuk stabilus jantan dan strobilus betina. Umumnya berkelamin tunggal namun ada juga yang berkelamin dua. Penyerbukan pada gymnospermae hampir selalu dengan cara anemogami (bantuan angin). Waktu penyerbukan sampai pembuahan relatif panjang. Gymnospermae dibagi menjadi empat klad, ada yang menjadikannya sebagai [[kelas (biologi)|kelas]], namun sekarang dianggap sebagai [[divisio|divisi]] tersendiri, yaitu:
* Cycadophyta (sebagai kelas berakhiran ''-psida'', sehingga menjadi Cycadopsida)
* Pinophyta (Pinopsida)
* Gnetophyta (Gnetopsida)
* Ginkgophyta (Ginkgopsida)
=== Anthophyta atau Angiospermae (tumbuhan berbunga) ===
