Epigenetika: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
Rheka (bicara | kontrib)
Tidak ada ringkasan suntingan
Rheka (bicara | kontrib)
Baris 37:
== Mekanisme epigenetika ==
[[Berkas:Epigenetic mechanisms.jpg|thumb|right|350px|Mekanisme Epigenetika: metilasi DNA dan modifikasi histon]]
Mekanisme epigenetika antara lain adalah [[metilasi DNA]], [[modifikasi histon]], dan [[perubahan bentuk kromatin]]<ref name="metilasi">{{en}}{{cite book
Mekanisme epigenetika yang paling umum dijumpai adalah [[metilasi DNA]]. Mekanisme lainnya adalah modifikasi [[histon]] dan perubahan bentuk [[kromatin]]. [[Metilasi]] sendiri merupakan peristiwa dimana terjadi penambahan gugus metil (CH3) pada [[sitosina]]. Mekanisme ini mendasari berbagai macam fenomena [[transkripsi]], termasuk imprinting, inaktivasi kromosom X, serta ''transgenerational epigenetic inheritance''.<ref>{{en}}{{cite journal| author= Dengke K. Ma, Junjie U. Guo, Guo-li Ming, Hongjun Song | date=2009-5-15 | title= DNA excision repair proteins and Gadd45 as molecular players for
active DNA demethylation| journal = Cell cycle | volume = 37 | page = 1526-1531 | DOI = Cell Cycle 8:10, 1526-1531; 15 May 2009 | URL = http://www.landesbioscience.com/journals/cc/article/8500}}</ref>
 
[[Enzim]] yang berperan dalam proses metilasi diantaranya adalah [[DNA metiltransferase (DNMT)]]. <ref>{{en}}{{cite journal| author= Dengke K. Ma, Junjie U. Guo, Guo-li Ming, Hongjun Song | date=2009-5-15 | title= DNA excision repair proteins and Gadd45 as molecular players for
active DNA demethylation| journal = Cell cycle | volume = 37 | page = 1526-1531 | DOI = Cell Cycle 8:10, 1526-1531; 15 May 2009 | URL = http://www.landesbioscience.com/journals/cc/article/8500}}</ref>. Proses demetilasi pada tumbuhan diketahui melibatkan 5-metilsitosina glikosilase melalui jalur koreksi DNA dengan pemotongan basa (''base excission repair''), sedangkan pada mamalia proses demetilasi ini belum diketahui secara pasti mekanismenya.<ref>{{en}}{{cite journal| author= Steen K.T. Ooi, Timothy. H. Bestor | date= 2008-7-27 | title= The Colourfull History of Active DNA Demethylation | journal = Cell | volume = 133 | page = 1145-1148 | DOI = DOI 10.1016/j.cell.2008.06.009}}</ref> Penelitian di awal tahun 2010 menyatakan proses demetilasi kemungkinan diperantarai suatu reaksi yang membutuhkan radikal S-adenosine metionin (SAM) utuh.<ref>{{en}}{{cite journal| author= Yuki Okada, Kazuo Yamagata, Kwonho Hong, Teruhiko Wakayama, Yi Zhang | date= 2010-1-28 | title= A Role for the Elongator Complex in zygotic paternal Genome Demethylation| journal = Nature | volume = 463 | page = 554-559 | DOI = 10.1038/nature08732}}</ref>
 
=== Metilasi DNA ===
Metilasi DNA terjadi pada posisi 5 dari cincin [[pirimidin]] [[sitosina]], dalam konteks dinukleotida CpG. <ref>{{en}}{{cite book
|last= Tost
|first= Jorg
Baris 54 ⟶ 47:
|location= New York
|id= ISBN: 978-1-934115-61-9
Mekanisme epigenetika yang paling umum dijumpai adalah [[metilasi DNA]]. Mekanisme lainnya adalah modifikasi [[histon]] dan perubahan bentuk [[kromatin]]}}</ref>. [[Metilasi]] sendiri merupakan peristiwa dimana terjadi penambahan gugus [[metil (CH3)]] pada [[sitosina]]. Mekanisme ini mendasari berbagai macam fenomena [[transkripsi]], termasuk imprinting, inaktivasi kromosom X, serta ''transgenerational epigenetic inheritance''.<ref>{{en}}{{cite journal| author= Dengke K. Ma, Junjie U. Guo, Guo-li Ming, Hongjun Song | date=2009-5-15 | title= DNA excision repair proteins and Gadd45 as molecular players for
}}</ref>
active DNA demethylation| journal = Cell cycle | volume = 37 | page = 1526-1531 | DOI = Cell Cycle 8:10, 1526-1531; 15 May 2009 | URL = http://www.landesbioscience.com/journals/cc/article/8500}}</ref>
 
=== Metilasi DNA ===
Metilasi DNA terjadi pada posisi 5 dari cincin [[pirimidin]] [[sitosina]], dalam konteks dinukleotida CpG. <ref>{{en}}{{cite bookname="metilasi"/>
[[Enzim]] yang berperan dalam proses metilasi diantaranya adalah [[DNA metiltransferase (DNMT)]]. <ref>{{en}}{{cite journal| author= Dengke K. Ma, Junjie U. Guo, Guo-li Ming, Hongjun Song | date=2009-5-15 | title= DNA excision repair proteins and Gadd45 as molecular players for
active DNA demethylation| journal = Cell cycle | volume = 37 | page = 1526-1531 | DOI = Cell Cycle 8:10, 1526-1531; 15 May 2009 | URL = http://www.landesbioscience.com/journals/cc/article/8500}}</ref>.
active DNA demethylation| journal = Cell cycle | volume = 37 | page = 1526-1531 | DOI = Cell Cycle 8:10, 1526-1531; 15 May 2009 | URL = http://www.landesbioscience.com/journals/cc/article/8500}}</ref>. Proses [[demetilasi]] pada tumbuhan diketahui melibatkan 5-metilsitosina glikosilase melalui jalur koreksi DNA dengan pemotongan basa (''base excission repair''), sedangkan pada mamalia proses demetilasi ini belum diketahui secara pasti mekanismenya.<ref>{{en}}{{cite journal| author= Steen K.T. Ooi, Timothy. H. Bestor | date= 2008-7-27 | title= The Colourfull History of Active DNA Demethylation | journal = Cell | volume = 133 | page = 1145-1148 | DOI = DOI 10.1016/j.cell.2008.06.009}}</ref> Penelitian di awal tahun 2010 menyatakan proses demetilasi kemungkinan diperantarai suatu reaksi yang membutuhkan radikal S-adenosine metionin (SAM) utuh.<ref>{{en}}{{cite journal| author= Yuki Okada, Kazuo Yamagata, Kwonho Hong, Teruhiko Wakayama, Yi Zhang | date= 2010-1-28 | title= A Role for the Elongator Complex in zygotic paternal Genome Demethylation| journal = Nature | volume = 463 | page = 554-559 | DOI = 10.1038/nature08732}}</ref>
 
=== Modifikasi histon ===
Modifikasi [[histon]] mempengaruhi perubahan bentuk kromatin.<ref name="metilasi"/>
 
=== Perubahan bentuk kromatin ===
Pada berbagai sel eukariota tingkat tinggi, ada dua tipe kromatin pada tahap [[interfase]] yaitu :<ref name="alberts">{{en}}{{cite book
| last = Alberts
| first = Bruce
| authorlink = Bruce Alberts
| coauthors = Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter
| title = Molecular Biology of the cell
| publisher = Garland Science
| year = 2008
| location =
| pages = 220
| url =
| doi =
| accessdate = 2010-03-31
| id = ISBN 978-0-8153-4106-2 }}</ref>
* [[Heterokromatin]], merupakan bentuk yang lebih padat<ref name="alberts"/>, atau bentuk tertutup<ref name="metilasi"/>.
* [[Eukromatin]], merupakan bentuk yang kurang padat<ref name="alberts"/>, atau bentuk terbuka<ref name="metilasi"/>.
Saat suatu gen yang secara normal [[ekspresi genetika|terekspresi]] pada bentuk eukromatin berpindah pada daerah heterokromatin, dapat menghentikan ekspresi gen tersebut.<ref name="alberts"/>
 
== Catatan kaki ==