Operon ara: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
25kartika (bicara | kontrib)
Tidak ada ringkasan suntingan
Kenrick95Bot (bicara | kontrib)
k Bot: perubahan kosmetika
Baris 6:
AraA merupakan L-Arabinosa isomerase yaitu suatu [[:en:Isomerase|isomerase]] yang berguna dalam perubahan L-Arabinosa menjadi [[isomer]]nya yaitu L-Ribulosa. AraA dikodekan oleh [[gen]] ''araA''.<ref name=Nogueire_1997>Nogueira IS, Nogueire TV,Soares S, Lencastre H.1997.'''The''' '''''Bacillus subtilis''''' '''L-arabinose (ara) operon: nucleotide sequence, genetic organization and expression'''. ''Microbiol''.(143):957-969.</ref>
===AraB===
AraB merupakan L-Ribulokinase yaitu suatu [[:en:Ribulokinase|ribulokinase]] yang berguna dalam penambahan gugus fosfat pada L-Ribulosa sehingga menjadi L-Ribulosa-5-fosfat. AraB dikodekan oleh gen ''araB''.<ref name=Nogueire_1997>Nogueira IS, Nogueire TV,Soares S, Lencastre H.1997.'''The''' '''''Bacillus subtilis''''' '''L-arabinose (ara) operon: nucleotide sequence, genetic organization and expression'''. ''Microbiol''.(143):957-969.</ref>
===AraD===
AraD merupakan L-Ribulosa-5-fosfat-4-epimerase yaitu suatu [[:en:Epimerase|epimerase]] yang berfungsi dalam perubahan L-Ribulosa-5-fosfat menjadi D-Xilulosa-5-fosfat yang selanjutnya dapat masuk kedalam dalam xylulose phosphate pathway yang merupakan salah satu jalur katabolisme untuk menghasilkan energi. AraD dikodekan oleh gen ''araD''.<ref name=Nogueire_1997>Nogueira IS, Nogueire TV,Soares S, Lencastre H.1997.'''The''' '''''Bacillus subtilis''''' '''L-arabinose (ara) operon: nucleotide sequence, genetic organization and expression'''. ''Microbiol''.(143):957-969.</ref>
Baris 16:
==Macam konformasi protein regulator==
 
AraC memiliki tiga bentuk [[konformasi]] yaitu satu sebagai [[monomer]] dan dua bentuk sebagai [[dimer]]. AraC tersusun atas ''C-terminal DNA binding domain'' yang terikat dengan ''N-terminal dimerization domain''. Pada ''N-terminal dimerization domain'' terdapat ''N-terminal arm'' yang dapat terikat pada ''C-terminal DNA binding domain'' pada [[molekul]] yang sama atau ''N-terminal dimerization'' domain pada partner molekul bergantung dengan keberadaan arabinosa.<ref name=Moat_2002>Moat AG, ''et al''.2002.''Microbial Physiology''.Wiley-Liss,Inc:New York.</ref>
===Tanpa Arabinosa===
Bila tidak ada arabinosa yang menempel pada ''Arabinosa binding site'' maka ''N-terminal arm'' akan menempel pada ''C-terminal DNA binding protein' membentuk kompleks yang kaku. Dimer dari bentuk tersebut membentuk kompleks yang lebih panjang.
Baris 25:
 
==Proses regulasi==
[[FileBerkas:Arabinose-1.png|thumb|250px|Bentuk konformasi arabinosa]]
===Dengan Arabinosa===
Jika terdapat arabinosa yang berikatan pada Arabinosa binding site maka AraC dimer akan lebih fleksibel sehingga dapat berikatan dengan I1 dan I2. I1 dan I2 memiliki lokasi yang berdekatan dengan RNA polimerase binding site sehingga keberadaan AraC pada I1 dan I2 ikut menginduksi keberadaan RNA polimerase sehingga terjadi [[transkripsi]] araBAD melalui [[promotor]] PBAD dan araC melalui promotor PC.<ref name=Moat_2002>Moat AG, ''et al''.2002.''Microbial Physiology''.Wiley-Liss,Inc:New York.</ref>
Baris 37:
== Referensi ==
{{reflist}}
 
 
[[Kategori:Biologi]]