Kali Mas merupakan sungai yang menjadi pintu gerbang [[Kerajaan Majapahit]], dan di sungai ini pernah terjadi pertempuran antara Raden Wijaya (pendiri Majapahit) melawan pasukan Tartar (Mongol) pada [[abad ke-13]].
Pada jamanzaman [[VOC]] [[Belanda]] kali mas ini menjadi salah satu sarana transportasi [[air]] yang sangat ramai digunakan. Hilir mudik sampan dan perahu kecil mengangkut barang komoditi dan ikan-ikan dari hasil tangkapan nelayan dari pelabuhan tanjung perak. Mereka membawa masuk komoditi tersebut ke daerah dalam kota, yang dikenal sebagai kembang jepun (daerah pecinan di Surabaya) hingga ke daerah kayun (sekarang dikenal dengan adanya Surabaya Mal). Dahulu di kayun dekat lokasi Surabaya Mal ini, terdapat jembatan gantung yang beroperasi saat ada kapal komoditas yang melintas masuk daerah tersebut. Namun kini jembatan tersebut sudah tidak dapat beroperasi lagi.
