Pada masa pra-Islam, bahasa Uighur ditulis dengan huruf [[Orkhon]] yang serupa dengan huruf [[Runik]], kemudian semenjak [[Islam]] mulai dianut masyarakat Uighur (tepatnya abad ke 10 Masehi), semua penulisan memakai huruf [[Abjad Arab|Arab]]. Pemerintah Komunis [[Tiongkok]] pada tahun 1969 berupaya memperkenalkan [[huruf Latin]] sebagai sistem penulisan manunggal bagi Bahasa Uighur, tetapi usaha tersebut tidak berhasil, sehingga pada tahun 1983 huruf [[Abjad Arab|Arab]] yang dimodifikasipun kembali diperkenalkan sebagai satu-satunya sistem penulisan bagi Bahasa Uighur. Perbedaannya adalah dengan ditambahkannya beberapa [[diakritik]] khusus yang sesuai dengan pengucapan lidah setempat. Sedangkan masyarakat Uighur di negara-negara bekas Uni Soviet menggunakan huruf [[Sirilik]]. Berikut ini contoh perbandingan sistem penulisan antara Arab-Uighur, Latin Turki dan Latin sistem IPA
Sedangkan masyarakat Uighur di negara-negara bekas Uni Soviet menggunakan huruf [[Sirilik]].
Berikut ini contoh perbandingan sistem penulisan antara Arab-Uighur, Latin Turki dan Latin sistem IPA
