Soemitro meninggal dunia di Rumah Sakit Dharma Nugraha, Jalan Balai Pustaka, Rawamangun, Jakarta Timur pada 9 Maret 20012003 dalam usia 84 tahun setelah cukup lama menderita penyakit jantung dan penyempitan pembuluh darah.<ref>https://m.liputan6.com/news/read/9221/sumitro-djojohadikusumo-meninggal-dunia</ref> Jenazah disemayamkan di rumah duka, Jalan Metro Kencana IV/22, Pondok Indah, [[Jakarta Selatan]]. Banyak sekali pelayat yang hadir, di antaranya pengusaha [[Dali Tahir]], pasangan pengusaha keturunan India Marimutu Manimaren dan Marimutu Sinivasan, Prof. [[Widjojo Nitikusumo]] beserta istrinya, mantan Wakil Gubernur DKI Jakarta [[Eddy Nalapraya]], tokoh [[Petisi 50]] [[Kemal Idris]], pengusaha Ciputra dan tokoh Poros Tengah, [[Fuad Bawazier]], Menteri Pendidikan [[Fuad Hasan]] dan mantan Wakil Presiden [[Try Soetrisno]]. Sesuai wasiatnya agar dimakamkan dengan cara dan di tempat sederhana, pihak keluarga pun memilih [[Taman Pemakaman Umum Karet Bivak]] Blok A III sebagai tempat persemayaman terakhir begawan ekonomi ini.<ref>{{cite web|url=https://nasional.tempo.co/read/25939/sumitro-minta-dimakamkan-secara-sederhana/|title=Sumitro Minta Dimakamkan Secara Sederhana|newspaper=[[Tempo.co]]|date=29 Oktober 2003|access-date=16 Desember 2018}}</ref>
