Buka menu utama
Rhizobium
Rhizobium tropici strain BR816 on TY agar.JPG
Rhizobium tropici on an agar plate.
Klasifikasi ilmiah
Kingdom: Bacteria
Filum: Proteobacteria
Kelas: Alphaproteobacteria
Ordo: Rhizobiales
Famili: Rhizobiaceae
Genus: Rhizobium
Frank 1889
Tipe spesies
Rhizobium leguminosarum
Spesies[1]

See text.

Rhizobium adalah genus bakteri tanah Gram-negatif yang memfiksasi nitrogen. Spesies Rhizobium membentuk asosiasi pengikat nitrogen endosimbiotik dengan akar kacang-kacangan dan Parasponia.

Bakteri ini mengkolonisasi sel-sel tumbuhan di dalam nodul akar, di mana mereka mengubah nitrogen atmosfer menjadi amonia dan kemudian memberikan senyawa nitrogen organik seperti glutamina atau ureida ke tanaman. Tanaman, pada gilirannya, menyediakan senyawa organik yang dibuat dengan fotosintesis untuk bakteri.[2] Hubungan yang saling menguntungkan ini terjadi pada semua rhizobia, di mana genus Rhizobium adalah contoh yang khas.

SejarahSunting

Martinus Beijerinck adalah yang pertama kali mengisolasi dan menumbuhkan mikroorganisme dari nodul kacang-kacangan pada tahun 1888. Ia menamakannya Bacillus radicicola, yang sekarang ditempatkan dalam Bergey's Manual of Determinative Bacteriology di bawah genus Rhizobium.

PenelitianSunting

Rhizobium membentuk hubungan simbiosis dengan tanaman tertentu seperti kacang-kacangan, memfiksasi nitrogen dari udara menjadi amonia, yang bertindak sebagai pupuk alami untuk tanaman. Penelitian saat ini sedang dilakukan oleh ahli mikrobiologi dari Agricultural Research Service untuk menemukan cara untuk memanfaatkan fiksasi nitrogen Rhizobium. Penelitian ini melibatkan pemetaan genetik dari berbagai spesies rhizobia dengan spesies tanaman simbiotik masing-masing, seperti alfalfa atau kedelai. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk meningkatkan produktivitas tanaman tanpa menggunakan pupuk.[3]

Dalam biologi molekuler, Rhizobium juga telah diidentifikasi sebagai pencemar dari kit pereaksi ekstraksi DNA dan sistem air ultra murni, sehingga Rhizobium dapat muncul secara keliru di kumpulan data mikrobiota atau metagenom.[4] Kehadiran bakteri pengikat nitrogen sebagai kontaminan mungkin karena penggunaan gas nitrogen dalam produksi air ultra-murni untuk menghambat pertumbuhan mikroba dalam tangki penyimpanan.[5]

SpesiesSunting

FilogeniSunting

Taksonomi yang diterima saat ini berdasarkan List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [1] dan National Center for Biotechnology Information (NCBI)[16] dan filogeninya berdasarkan LTP rilis 106 berbasis 16S rRNA oleh The All-Species Living Tree Project.[17]
















Rhizobium lusitanum Valverde et al. 2006



Rhizobium rhizogenes (Riker et al. 1930) Young et al. 2001



Agrobacterium rubi Hildebrand 1940





Rhizobium multihospitium Han et al. 2008



Rhizobium tropici Martínez-Romero et al. 1991




Rhizobium miluonense Gu et al. 2008





Rhizobium leguminosarum (Frank 1879) Frank 1889 (Approved Lists 1980) emend. Ramírez-Bahena et al. 2008[18]






Rhizobium endophyticum López-López et al. 2011



Rhizobium tibeticum Hou et al. 2009




Rhizobium etli Segovia et al. 1993





Rhizobium pisi Ramírez-Bahena et al. 2008




Rhizobium phaseoli Dangeard 1926 (Approved Lists 1980) emend. Ramírez-Bahena et al. 2008



Rhizobium fabae Tian et al. 2008




Rhizobium hainanense Chen et al. 1997





Arthrobacter viscosus Gasdorf et al. 1965[19]



Rhizobium alamii Berge et al. 2009



Rhizobium mesosinicum Lin et al. 2009





Rhizobium sullae Squartini et al. 2002




Rhizobium indigoferae Wei et al. 2002




Rhizobium gallicum Amarger et al. 1997



Rhizobium yanglingense Tan et al. 2001




Rhizobium mongolense Van Berkum et al. 1998



Rhizobium oryzae Peng et al. 2008




Rhizobium loessense Wei et al. 2003




Rhizobium tubonense Zhang et al. 2011







Rhizobium cellulosilyticum García-Fraile et al. 2007



Rhizobium soli Yoon et al. 2010





Neorhizobium galegae Lindström 1989



Neorhizobium vignae Ren et al. 2011





Neorhizobium huautlense Wang et al. 1998



Neorhizobium alkalisoli Lu et al. 2009




ReferensiSunting

  1. ^ a b J.P. Euzéby. "Rhizobium". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Diarsipkan dari versi asli tanggal 2012-05-23. Diakses tanggal 2012-05-02. 
  2. ^ Sawada H, Kuykendall LD, Young JM (2003). "Changing concepts in the systematics of bacterial nitrogen-fixing legume symbionts". J. Gen. Appl. Microbiol. 49 (3): 155–79. doi:10.2323/jgam.49.155. PMID 12949698. 
  3. ^ "Marvelous Microbe Collections Accelerate Discoveries To Protect People, Plants—and More!". Agricultural Research. United States Department of Agriculture. January 2010. Diakses tanggal 10 August 2018. 
  4. ^ Templat:Cite biorxiv
  5. ^ Kulakov, L; McAlister, M; Ogden, K; Larkin, M; O'Hanlon, J (2002). "Analysis of Bacteria Contaminating Ultrapure Water in Industrial Systems". Applied and Environmental Microbiology. 68: 1548–1555. doi:10.1128/AEM.68.4.1548-1555.2002. PMC 123900 . PMID 11916667. 
  6. ^ NOTE: This strain was formerly named Blastobacter aggregatus.
  7. ^ NOTE: This species was formerly known as R. leguminosarum sv. phaseoli.
  8. ^ a b Amarger N, Macheret V, Laguerre G (1997). "Rhizobium gallicum sp. nov. and Rhizobium giardinii sp. nov., from Phaseolus vulgaris nodules". Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (4): 996–1006. doi:10.1099/00207713-47-4-996. PMID 9336898. 
  9. ^ a b c NOTE: R. gallicum and R. mongolense are 99.2% identical in their rDNA and may be the same species. It has been proposed by Silva et al. that R. mongolense and R. yanglingense be reclassified as R. gallicum sv. orientale.
  10. ^ Diange, E. A.; Lee, S. S. (2013). "Rhizobium halotolerans sp. nov., Isolated from Chloroethylenes Contaminated Soil". Current Microbiology. 66 (6): 599–605. doi:10.1007/s00284-013-0313-x. PMID 23377488. 
  11. ^ a b Marek-Kozaczuk M, Leszcz A, Wielbo J, Wdowiak-Wróbel S, Skorupska A (2013). "Rhizobium pisi sv. trifolii K3.22 harboring nod genes of the Rhizobium leguminosarum sv. trifolii cluster". Syst. Appl. Microbiol. 36 (4): 252–8. doi:10.1016/j.syapm.2013.01.005. PMID 23507586. 
  12. ^ Kesari, V.; Ramesh, A. M.; Rangan, L. (2013). "Rhizobium pongamiae sp. nov. From Root Nodules of Pongamia pinnata". BioMed Research International. 2013: 1–9. doi:10.1155/2013/165198. 
  13. ^ Xu, Lin; Zhang, Yong; Deng, Zheng Shan; Zhao, Liang; Wei, Xiu Li; Wei, Ge Hong (2013). "Rhizobium qilianshanense sp. nov., a novel species isolated from root nodule of *Oxytropis ochrocephala Bunge in China". Antonie van Leeuwenhoek. 103 (3): 559–565. doi:10.1007/s10482-012-9840-x. 
  14. ^ Turdahon M, Osman G, Hamdun M, Yusuf K, Abdurehim Z, Abaydulla G, Abdukerim M, Fang C, Rahman E (2012). "Rhizobium tarimense sp. nov. isolated from soil in the ancient Khiyik river of Xinjiang, China". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 63 (Pt 7): 2424–9. doi:10.1099/ijs.0.042176-0. PMID 23203621. 
  15. ^ Fang Wang; En Tao Wang; Li Juan Wu; Xin Hua Sui; Ying Li Jr. & Wen Xin Chen (2011). "Rhizobium vallis sp. nov., isolated from nodules of three leguminous species". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61 (11): 2582–2588. doi:10.1099/ijs.0.026484-0. PMID 21131504. 
  16. ^ Sayers; et al. "Rhizobium/Agrobacterium group". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Diakses tanggal 2012-05-02. 
  17. ^ All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Diakses tanggal 2012-05-02. 
  18. ^ This is the type species for the genus.
  19. ^ Arthrobacter viscosus sekarang diklasifikasikan dalam Micrococcaceae. Lihat Arthrobacter.

Pranala luarSunting