KEGG
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) adalah kumpulan database yang berkaitan dengan genom, pathway biologi, penyakit, obat, dan bahan kimia. KEGG digunakan untuk riset dan pengajaran bioinformatika, termasuk analisis data dalam genomika, metagenomika, metabolomika dan studi omika lainnya, perancangan model dan simulasi dalam sistem biologi, serta riset translational dalam pengembangan obat.
| Konten | |
|---|---|
| Deskripsi | Bioinformatics resource for deciphering the genome. |
| Organisme | All |
| Kontak | |
| Pusat penelitian | Kyoto University |
| Laboratorium | Kanehisa Laboratories |
| Kutipan utama | PMID 10592173 |
| Tanggal rilis | 1995 |
| Akses | |
| Situs web | www |
| URL layanan web | REST see KEGG API |
| Perangkat | |
| Web | KEGG Mapper |
| Lain-lain | |
Sejarah sunting
Proyek database KEGG dimulai pada tahun 1995 oleh Minoru Kanehisa, Professor pada Institute for Chemical Research, Kyoto University, yang saat itu berada di bawah Human Genome Program Jepang.[1][2] Menurut para developernya, KEGG merupakan suatu "computer representation" dari sistem biologi.[3]
- Informasi sistem
- PATHWAY—peta pathway untuk fungsi-fungsi seluler dan organismal
- MODULE—modul atau unit fungsional gen
- BRITE—klasifikasi hierarkis entiti biologi
- Informasi genomik
- Informasi kimia
- COMPOUND, GLYCAN—senyawa kimia dan glikan
- REACTION, RPAIR, RCLASS—reaksi kimia
- ENZYME—nomenklatur enzim
- Informasi kesehatan
- DISEASE—penyakit manusia
- DRUG—obat yang sudah diberi izin
- ENVIRON—obat mentah dan bahan terkait kesehatan
Lihat pula sunting
- Comparative Toxicogenomics Database - CTDintegrates KEGG pathways with toxicogenomic and disease data
- ConsensusPathDB, a molecular functional interaction database, integrating information from KEGG
- Gene ontology
- PubMed
- Uniprot
- Gene Disease Database
Referensi sunting
- ^ Kanehisa M, Goto S (2000). "KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes". Nucleic Acids Res. 28 (1): 27–30. doi:10.1093/nar/28.1.27. PMC 102409
. PMID 10592173.
- ^ Kanehisa M (1997). "A database for post-genome analysis". Trends Genet. 13 (9): 375–6. doi:10.1016/S0168-9525(97)01223-7. PMID 9287494.
- ^ Kanehisa M, Goto S, Hattori M, Aoki-Kinoshita KF, Itoh M, Kawashima S, Katayama T, Araki M, Hirakawa M (2006). "From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG". Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D354–7. doi:10.1093/nar/gkj102. PMC 1347464 . PMID 16381885.
Pranala luar sunting
- KEGG website
- GenomeNet mirror site
- The entry for KEGG Diarsipkan 2012-04-02 di Wayback Machine. dalam MetaBase