Kecelakaan ini menyebabkan1. tiga gerbong KA tersebut terguling, tiga lainnya anjlok dan sisanya masih berada di rel.<ref name="Kemenhub">[http://antaranews.com/berita/1277815845/kemenhub-kirimkan-tim-evaluasi-perjalanan-ka-logawa Kemenhub Kirimkan Tim Evaluasi Perjalanan KA Logawa], diakses pada 30 Juni 2010</ref> Akibat kecelakaan ini menyebabkan 6 orang tewas, 5 orang luka berat, dan 73 orang lainnya mengalami luka-luka.<ref name="Kemenhub"></ref><ref name="KNKT: KA Logawa">[http://id.news.yahoo.com/lptn/20100630/tid-knkt-ka-logawa-diduga-melebihi-kecep-e390447.html KNKT: KA Logawa Diduga Melebihi Kecepatan], diakses pada 30 Juni 2010</ref>
2. Telatnya KA [[kereta gaya baru malam selatan|GBMS]] tiba di [[Stasiun gubeng|Surabaya Gubeng]] pukul 11.39 (seharusnya 02.29)
Setelah kecelakaan ini penumpang dari gerbong 5 hingga 8 dipindahkan ke gerbong 1 hingga 4 dan melanjutkan perjalanan hingga ke Stasiun Wilangan, kemudian sebagian penumpang diangkut dengan bus dan mobil polisi.<ref name="Kereta Logawa"></ref>
3. Telatnya KA [[Kereta api bima|KA BIMA]] tiba di [[Stasiun gubeng|Surabaya Gubeng]] pukul 12.03 (seharusnya 05.39)
