'''Gereja Kristen Protestan Indonesia''' disingkat '''GKPI''', adalah salah anggota resmi Persekutuan Gereja-gereja di Indonesia (PGI). Kantor Pusat GKPI berkedudukan di Jl. Kapt. M.H. sitorus No. 13 Pematangsiantar, Sumatra Utara, Indonesia. Jemaat-jemaat GKPI tersebar di sejumlah daerah di IndoensiaIndonesia, hingga ke Balik Papan Kalimantan. GKPI adalah [[gereja]] yang memisahkan diri dari [[HKBP]] karena adanya keinginan untuk adanya pembaharuan di tubuh HKBP pada waktu itu, awal tahun 1960-an. Untuk tujuan pembaharuan itu dibentuklah "dewan patotahon" atau dewan pembaharu. Namun kesepakatan tidak dapat dicapai sehingga perbedaan pendapat atau perselisihan antara lain berkaitan dengan hubungan Gereja HKBP dengan [[Universitas Nommensen]] semakin besar. Pertikaian memuncak dalam Rapat/Sinode Khusus yang dilangsungkan di [[Parapat]], Sumatera Utara tanggal [[19 Juli|19]] - [[25 Juli]] [[1964]]. Sebagian peserta [[Sinode]] mengundurkan diri. Lalu bersama sebagian jemaat HKBP mendirikan gereja baru pada tanggal [[30 Agustus]] [[1964]] di [[Pematang Siantar]] dan mengangkat [[Dr. Andar Lumbantobing]], seorang dosen dan rektor Universitas Nommensen sebagai pimpinan (disebut [[Bishop]])dan Pdt.[[Dr. Sutan M. Hutagalung]], juga dosen di Nommensen, sebagai Sekretaris Jenderal. Ia berdua memimpin GKPI hingga tahun 1988. Periode 1988-1993 GKPI dipimpin oleh Bisho Pdt. R.M.G. Marbun dan Sekjen Pdt. O.Siahaan. Pada priode 1993-1988, GKPI dipimpin oleh Bishop Pdt. R.M.G. Marbun dan Sekjen. Pdt. M.S.E. Simorangkir. Pada Periode 1998-2000 GKPI dipimpin oleh Bishop Pdt. C.W.Panjaitan dan Sekjen Pdt. S.P.Hutagalung. Pada periode thn 2000-2005, GKPI dipimpin oleh Bishop Pdt. G.O.P. Manurung dan Sekjen Pdt. S.P. Hutagalung. Pada (periode 2005-2010) jabatan Bishop diduduki oleh Pdt. [[Mangisi S.E Simorangkir]] dan Sekjen Pdt. [[Maurids Simamora]]. Doktrin dan teologi gereja ini tidak berbeda jauh dengan HKBP.
