Sisca awalnya beragama [[Kristen]], namun ia berpindah agama menjadi [[Islam]] ketika menikah dengan [[Fadlan Muhammad]] pada 22 September 2002. Mereka dikaruniai seorang anak laki-laki pada 10 Desember 2004 dengan nama Muhammad Danish Zidane dan dua orang anak kembar yang berbeda jenis kelamin
pada 31 Januari 2007, yaitu Muhammad MikhailMikail AttalaAthalla dan Chiara QuincyQueency Alicia. Namun, pernikahan mereka berakhir dengan perceraian pada bulan April 2012.<ref name="Perceraian">{{cite news|title=Sisca Magdalena (Mantan Istri Fadlan): Perceraian Kami Tak Ada Hubungannya dengan Orang Ketiga|url=https://archive.tabloidbintang.com/berita/gosip/61016-sisca-magdalena-mantan-istri-fadlan-perceraian-kami-tak-ada-hubungannya-dengan-orang-ketiga.html|first= |last= |date= |accessdate=|language= |website= |archive-date=|archive-url=|dead-url=no}}</ref><ref>{{cite news|title=Presenter Fadlan Pisah dengan Sisca|url=https://www.viva.co.id/showbiz/302730-presenter-fadlan-pisah-dengan-sisca|first= |last= |date= |accessdate=|language= |website=[[Viva.co.id]] |archive-date=|archive-url=|dead-url=no}}</ref> Pada 23 Juli 2016, Sisca melangsungkan pernikahannya yang kedua dengan Martin Engelbrecht di Bracha Uluwatu, [[Bali]].
