Langkah ini menuai kecaman dari beberapa pihak. Dalam pernyataan bersama, para pemimpin partai oposisi Yunani mengatakan bahwa langkah Ankara adalah tindakan provokatif. ”Menunjukkan rasa tidak hormat terhadap orang Kristen Ortodoks di seluruh dunia dan tidak sejalan dengan program Eropa-Turki,” bunyi pernyataan bersama itu, seperti dikutip dari ''Russia Today'', Rabu (8/6/2016).<ref>{{Cite web}}</ref>
Pada salah satu kampanye [[Partai Keadilan dan Pembangunan]] (AKP, Presiden Turki [[Recep Tayyip ErdoganErdoğan]] menjanjikan untuk mengembalikan fungsi Aya Sofia sebagai masjid, sesuai dengan usulan dan keinginan rakyat Turki (27/03/2019)<ref>{{Cite web|url=https://internasional.kompas.com/read/2019/03/28/06441911/erdogan-waktunya-telah-tiba-mengembalikan-hagia-sophia-sebagai-masjid|title=Erdogan: Waktunya Telah Tiba Mengembalikan Hagia Sophia sebagai Masjid|last=Media|first=Kompas Cyber|website=KOMPAS.com|language=id|access-date=2020-07-16}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://www.cnnindonesia.com/internasional/20190328184553-134-381572/presiden-turki-berniat-buat-hagia-sophia-kembali-jadi-masjid|title=Presiden Turki Berniat Buat Hagia Sophia Kembali Jadi Masjid|website=internasional|language=id-ID|access-date=2020-07-16}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://internasional.kompas.com/read/2019/03/25/20362191/erdogan-bisa-kembalikan-hagia-sophia-sebagai-masjid|title=Erdogan Bisa Kembalikan Hagia Sophia sebagai Masjid|last=Media|first=Kompas Cyber|website=KOMPAS.com|language=id|access-date=2020-07-16}}</ref>. Mengenai kecaman dan protes dari berbagai pihak atas perubahan fungsi Aya Sofia, Presiden ErdoganErdoğan membandingkan peristiwa yang terjadi tidak lama sebelumnya, yaitu serangan yang menargetkan Masjid Al Aqsha di Yerussalem dan pihak lain hanya diam, begitu pula jika Aya Sofia menjadi masjid seharusnya pihak lain cukup diam, tidak perlu melayangkan protes dan kecaman.
Pada Bulan Juni 2020, beberapa Uskup Katolik di Turki dan tokoh-tokoh Katolik Roma menyatakan dukungan secara tidak langsung terhadap keputusan pemerintah Turki atas status Aya Sofia. Menurut mereka, Permerintah Turki memiliki kedaulatan untuk menentukan eksistensi dan status Aya Sofia. Sedangkan Patriarki Armenia mendukung keputusan pemerintah disertai dengan harapan agar selain dialih-fungsikan sebagai masjid, pada bagian tertentu di Aya Sofia diberikan ruangan untuk tempat beribadah umat Kristen. Hal tersebut dimaksudkan untuk menunjukkan pesan perdamaian, toleransi, dan hubungan yang lebih erat antara Islam dan Kristen<ref>{{Cite web|url=https://republika.co.id/share/qciifh440|title=Uskup Katolik: Hagia Sophia Sepenuhnya Hak Turki|date=2020-06-26|website=Republika Online|language=id|access-date=2020-07-16}}</ref>.
Akhirnya pada tanggal 10 Juli 2020, Pengadilan tinggi Turki membatalkan keputusan 1943 yang mengubahstatus Aya Sofia menjadi museum. Seiring dengan keputusan tersebut, pada tanggal yang sama Presiden Turki Recep Tayyip ErdoganErdoğan mengeluarkan dekrit yang berisi ''"Hagia Sophia kembali ke fungsinya semula sebagai tempat ibadah umat Islam. Ibadah pertama bisa dilakukan mulai 24 Juli mendatang.".''<ref>{{Cite web|url=https://twitter.com/rterdogan/status/1281589428469760000?|title=https://twitter.com/rterdogan/status/1281589428469760000?|website=Twitter|language=id|access-date=2020-07-16}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://www.npr.org/2020/07/10/889691777/turkish-court-ruling-clears-way-for-hagia-sophia-to-be-converted-to-a-mosque|title=Turkey Converts Istanbul's Iconic Hagia Sophia Back Into A Mosque|website=NPR.org|language=en|access-date=2020-07-16}}</ref><ref>{{Cite news|title=Turkey turns iconic Istanbul museum into mosque|url=https://www.bbc.com/news/world-europe-53366307|newspaper=BBC News|date=2020-07-10|access-date=2020-07-16|language=en-GB}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://riaupos.jawapos.com/internasional/12/07/2020/234735/turki-putuskan-hagia-sophia-jadi-masjid.html|title=Turki Putuskan Hagia Sophia Jadi Masjid|last=Pos|first=Riau|date=2020-07-12|website=RiauPos.co|language=id|access-date=2020-07-16}}</ref>. Meskipun telah beralih-fungsi sebagai masjid, Aya Sofia tetap terbuka untuk umum yang ingin berkunjung ke Aya Sofia.
