Arkea: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
k Bot: Perubahan kosmetika
Baris 181:
=== Hubungan dengan eukariota ===
 
Hubungan evolusi antara arkea dan [[eukariota]] masih belum jelas. Selain dari kesamaan dalam struktur sel dan fungsi sel yang dibahas di bawah, banyak pohon genetik mengelompokkan keduanya.
 
Faktor yang memperrumit termasuk klaim bahwa hubungan antara eukariota dan filum arkea [[Crenarchaeota]] lebih dekat daripada hubungan antara [[Euryarchaeota]] dan filum Crenarchaeota<ref>{{
cite journal |author=Lake JA |title=Origin of the eukaryotic nucleus determined by rate-invariant analysis of rRNA sequences |journal=Nature |volume=331 |issue=6152 |pages=184–6 |date=January 1988 |pmid=3340165 |doi=10.1038/331184a0|bibcode = 1988Natur.331..184L }}</ref> dan adanya gen seperti-arkea pada bakteri tertentu, seperti ''[[Thermotogae|Thermotoga maritima]]'', dari [[transfer gen horizontal]].<ref>{{
cite journal |author=Nelson KE, Clayton RA, Gill SR |title=Evidence for lateral gene transfer between Archaea and bacteria from genome sequence of Thermotoga maritima |journal=Nature |volume=399 |issue=6734 |pages=323–9 |year=1999 |pmid=10360571 |doi=10.1038/20601 |last12=Utterback |first12=TR |last13=Malek |first13=JA |last14=Linher |first14=KD |last15=Garrett |first15=MM |last16=Stewart |first16=AM |last17=Cotton |first17=MD |last18=Pratt |first18=MS |last19=Phillips |first19=CA |last20=Richardson |first20=D |last21=Heidelberg |first21=J |last22=Sutton |first22=GG |last23=Fleischmann |first23=RD |last24=Eisen |first24=JA |last25=White |first25=O |last26=Salzberg |first26=SL |last27=Smith |first27=HO |last28=Venter |first28=JC |last29=Fraser |first29=CM |bibcode=1999Natur.399..323N|author2=and others |displayauthors=1 |last3=Gill |last4=Gwinn |last5=Dodson |last6=Haft |last7=Hickey |last8=Peterson |last9=Nelson |last10=Ketchum |last11=McDonald }}</ref> Hipotesis standar menyatakan bahwa nenek moyang eukariota menyimpangberpisah awal dari Archaea,<ref>{{
cite journal |author=Gouy M, Li WH |title=Phylogenetic analysis based on rRNA sequences supports the archaebacterial rather than the eocyte tree |journal=Nature |volume=339 |issue=6220 |pages=145–7 |date=May 1989 |pmid=2497353 |doi=10.1038/339145a0|bibcode = 1989Natur.339..145G |last2=Li }}</ref><ref>{{cite journal |author=Yutin N, Makarova KS, Mekhedov SL, Wolf YI, Koonin EV |title=The deep archaeal roots of eukaryotes |journal=Mol. Biol. Evol. |date=May 2008 |pmid=18463089 |doi=10.1093/molbev/msn108 |url=http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/reprint/msn108v1 |volume=25 |pages=1619–30 |issue=8 |pmc=2464739|last2=Makarova |last3=Mekhedov |last4=Wolf |last5=Koonin }}</ref> dan bahwa eukariota muncul melalui fusi dari archaeaarkea dan eubacteriumbakteri, yang menjadi inti dan [[sitoplasma]]; ini menjelaskan berbagai kesamaan genetik tetapi berjalan kekesulitan dalam kesulitan menjelaskan struktur sel.<ref>{{
cite journal |author=Lake JA. |title=Origin of the eukaryotic nucleus determined by rate-invariant analysis of rRNA sequences |journal=Nature |volume=331 |issue=6152 |pages=184–6 |year=1988 |pmid=3340165 |doi=10.1038/331184a0|bibcode = 1988Natur.331..184L }}</ref> Sebuah hipotesis alternatif, [[hipotesis eosit]], berpendapat bahwa [[Eukaryota]] muncul relatif terlambat dari Archaea.<ref name=2domains>{{cite journal |first1=Tom A. |last1= Williams |first2=Peter G. |last2=Foster |first3=Cymon J. |last3=Cox |first4=T. Martin |last4=Embley |title=An archaeal origin of eukaryotes supports only two primary domains of life |journal=Nature |volume=504 |issue=7479 |pages=231–236 |date=December 2013 |url=http://www.nature.com/nature/journal/v504/n7479/full/nature12779.html |doi=10.1038/nature12779 |pmid=24336283|bibcode= 2013Natur.504..231W }}</ref>
 
Sebuah garis keturunan baruarkea yang ditemukan daripada arkea2015, ''[[Lokiarchaeum]]'' (dari filum baru [[Lokiarchaeota]]), dinamakandinama untukbardasarkan sebuah [[ventilasi hidrotermal]] yang disebut [[Kastil Loki]] di Samudra Arktik, telah ditemukan palingsebagai eratkelompok yang paling kaitannyaberkerabat dengan eukariota. Organisme ini telah disebut organisme peralihan antara prokariota dan eukariota.<ref name="NYT-20150506">{{cite news|last=Zimmer|first=Carl|authorlink=Carl Zimmer|title=Under the Sea, a Missing Link in the Evolution of Complex Cells|url=http://www.nytimes.com/2015/05/07/science/under-the-sea-a-missing-link-in-the-evolution-of-complex-cells.html|date=May 6, 2015|work=[[New York Times]]|accessdate=May 6, 2015 }}</ref><ref>{{Cite journal|title = Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes|url = http://www.nature.com/doifinder/10.1038/nature14447|journal = Nature|pmc = 4444528|pmid = 25945739|pages = 173–179|volume = 521|issue = 7551|doi = 10.1038/nature14447|first = Anja|last = Spang|first2 = Jimmy H.|last2 = Saw|first3 = Steffen L.|last3 = Jørgensen|first4 = Katarzyna|last4 = Zaremba-Niedzwiedzka|first5 = Joran|last5 = Martijn|first6 = Anders E.|last6 = Lind|first7 = Roel van|last7 = Eijk|first8 = Christa|last8 = Schleper|first9 = Lionel|last9 = Guy|date = 2015|bibcode = 2015Natur.521..173S}}</ref>
 
Sampai saat ini, beberapa filum saudara dari "Lokiarchaeota" telah ditemukan ("[[Thorarchaeota]]", "[[Odinarchaeota]]", "[[Heimdallarchaeota]]"), semuanya membentuk sebuah supergrup Asgard yang baru diajukan, yang mungkin merupakan takson saudara dari TACK.<ref name="NCBI taxonomy page on Archaea" /><ref name="ZN_Asgard2017"/><ref>{{cite journal |last1=Seitz|first1=Kiley W.|last2=Lazar|first2=Cassandre S.|last3=Hinrichs|first3=Kai-Uwe|last4=Teske|first4=Andreas P.|last5=Baker|first5=Brett J.|title=Genomic reconstruction of a novel, deeply branched sediment archaeal phylum with pathways for acetogenesis and sulfur reduction |journal=ISME Journal |date=2016 |volume=10 |issue=7 |pages=1696–1705 |doi=10.1038/ismej.2015.233 |pmid=26824177}}</ref> Rincian dari hubungan anggota Asgard dan eukariota masih dalam pertimbangan.