Juni mengawali karier profesionalnya di [[PSIM Yogyakarta]], klub yang pernah juga dibela oleh ayahnya, [[Iswanto Edi Syahputra]].<ref>{{cite web |url =http://jogja.tribunnews.com/2016/05/09/sang-striker-psim-juni-riadi-punya-impian-tampil-di-kasta-tertinggi|title = Sang Striker PSIM, Juni Riadi Punya Impian Tampil di Kasta Tertinggi|publisher = tribunnews.com|accessdate = 09 Februari 2017}}</ref>. Gol pertama untuk [[PSIM Yogyakarta]] dicetak saat mengandaskan [[Persipur Purwodadi]] 3-0 di kompetisi [[Indonesia Soccer Championship B 2016]]<ref>{{cite web |url =http://www.solopos.com/2016/05/07/isc-b-2016-psim-jogja-tekuk-persipur-3-0-717240|title = PSIM Jogja Tekuk Persipur 3-0|publisher = solopos.com|accessdate = 09 Februari 2017}}</ref>.
