Sebagian besar penduduk Kabupaten Tapanuli Tengah memeluk Agama ([[Kristen Protestan]] 45,31% dan [[Katolik]] 11,61%), Agama [[Islam]] (42.71%), [[Buddha]] (0,07%), dan [[Hindu]](0,01%)<ref>[http://sp2010.bps.go.id/index.php/site/tabel?tid=321&wid=1200000000 Sensus Penduduk 2010]</ref>. Agama Kristen Protestan/Katolik banyak dianut oleh Suku Batak Toba, Suku Karo, Batak Dairi, Batak Simalungun, Nias. Agama Islam di Tapanuli Tengah dianut oleh Suku Batak Angkola, Suku Mandailing dan Suku Melayu. Agama Buddha dianut oleh orang-orang yang beretnis Tionghoa. Dan Agama Hindu banyak dianut oleh suku dari Bali.
