Secara keseluruhan, terdapat 14 jenis enzim yang tergolong dalam kelas enzim metaloprotease dan kebanyakan diantaranya diaktivasi oleh ion [[seng|Zn]].<ref>Rawlings ND, Tolle DP, Barrett AJ. 2004. MEROPS: the peptidase database. ''Nucleic Acids Res'' 32.</ref> Ion logam lainnya yang dapat digunakan sebagai aktivator adalah [[mangan]] (Mn), [[kobalt]] (Co), [[nikel]] (Ni), dan [[tembaga]] (Cu).<ref name=book1></ref> Ion-ion logam tersebut akan terikat kuat membentuk suatu kompleks enzim.<ref name=book1></ref> Beberapa [[asam amino]] menjadi perantara ikatan ini, antara lain [[histamin]], [[aspartat]], [[glutamat]], dan [[lisin]].<ref name=book1></ref> Enzim-enzim ini dapat ditemukan pada banyak [[mikroorganisme]], seperti ''Bacillus thermoproteolyticus'', ''Vibrio alginolyticus'', ''Thermus aquaticus'', ''Bacillus anthractis'', dan ''[[Escherichia coli]]''.<ref name=book1></ref> Beberapa jenis [[fungi]] juga mampu menghasilkan enzim metaloprotease, seperti ''[[Aspergillus niger]]'' dan ''[[Saccharomyces cerevisiae]]''.<ref>Barrett AJ, Rawlings ND, Woessner JF. 2004. Handbook of Proteolytic Enzymes. Ed ke-2. Amsterdam: Elsevier Academic Press. Halaman 231.</ref>
