Memulai karirkarier mudanya di klub [[CD Guadalajara|Guadalajara]] di musim 2004-05. Pada musim panas 2007, dia ditransfer ke [[Rayo Vallecano]]. Selama 4 musim, dia bermain di tim cadangan. Pada 5 Juni 2011, dia memainkan debutnya di tim senior saat kalah 2-3 dari [[FC Barcelona B]].<ref>[http://archivo.rayoherald.com/177-juancar-deja-el-guadalajara-para-fichar-por-el-rayo.html Juancar deja el Guadalajara para fichar por el Rayo]; Rayo Herald, 26 Juli 2005 {{es icon}}</ref><ref>[http://www.marca.com/2011/06/04/futbol/2adivision/1307213738.html Soberbio punto y final del filial en el adiós de Vallecas a Segunda ]; [[Marca (surat kabar)|Marca]], 4 Juni 2011 {{es icon}}</ref>
Pada 4 Juli 2011, dia ditransfer ke [[Hércules CF]]<ref name="archivo.rayoherald.com">[http://archivo.rayoherald.com/18596-el-rayo-vallecano-no-cuenta-con-juan-carlos.html El Rayo Vallecano no cuenta con Juan Carlos]; Rayo Herald, 2 Juli 2011 {{es icon}}</ref>. Dan pada 2 Juli 2013, dia direkrut secara gratis oleh [[Córdoba CF]], setelah menolak memperpanjang kontraknya bersama Hercules<ref>[http:// name="archivo.rayoherald.com"/18596-el-rayo-vallecano-no-cuenta-con-juan-carlos.html El Rayo Vallecano no cuenta con Juan Carlos]; Rayo Herald, 2 Juli 2011 {{es icon}}</ref><ref>[http://www.abc.es/agencias/noticia.asp?noticia=867446 El guardameta Juan Carlos (Rayo Vallecano) firma dos años con el Hércules]; [[ABC]], 4 Juli 2011 {{es icon}}</ref><ref>[http://www.marca.com/2013/07/02/futbol/equipos/cordoba/1372790461.html Juan Carlos defenderá la portería del Córdoba]; Marca, 2 Juli 2013 {{es icon}}</ref>
